中新社上海三月一日電 針對陳水扁強行決定終止“國統會”運作和“國統綱領”適用，中共中央臺灣工作辦公室、國務院臺灣事務辦公室受權發表聲明揭露了陳水扁挑釁臺海和平、制造兩岸緊張的險惡用心，同時，再一次表達了祖國大陸從臺灣民眾利益出發，爭取和平統一，反對“臺獨”的堅定決心。對此，此間媒體報道了上海研究臺灣問題的專家、學者的強烈反應，他們指出，陳水扁逆時而動終為世界所棄，如意算盤必成泡影。
上海國際問題研究所副所長楊潔勉說，陳水扁于二月二十八日公文批示終止“國統會”運作和“國統綱領”適用，是在“臺獨”的死胡同里又跨出了危險的一大步。陳水扁試圖通過此舉實現其“法理臺獨”，不僅再度造成兩岸關系的緊張對峙，還威脅到臺海地區及亞太地區的和平與穩定。事實證明，祖國大陸“一國兩制、和平統一”的方針，得到了向往和平與發展的國家和人民的普遍支持。陳水扁蓄意破壞兩岸積極交往的發展勢頭，與和平發展的世界潮流背道而馳，最終必將為世界所棄。
上海社會科學院臺灣研究中心秘書長王海良認為，陳水扁的如意算盤是以推進“法理臺獨”謀取在“臺獨基本教義派”中的地位，同時挑起族群爭斗，煽起統“獨”烽煙，為民進黨贏得二00八年選舉創造條件。但這只能是一廂情愿，臺灣在野黨有識之士是不會落入陳水扁的圈套的，國民黨、親民黨“立委”已提出罷免陳水扁，喪失了政治信譽的陳水扁已經沒有多少政治資本可以運用了。
上海東亞研究所所長助理胡凌煒則表示，自陳水扁上臺以來，為其一己之私，不斷制造兩岸的對峙與緊張，為“臺獨”勢力拓展社會基礎。然而，二00五年，隨著連宋相繼訪問祖國大陸，祖國大陸陸續推出一系列有利于臺灣民眾的政策，使廣大臺灣民眾認識到臺灣的經濟發展離不開大陸。臺灣民眾對建立和諧健康兩岸關系的訴求瓦解了“臺獨”勢力賴以生存的社會基礎。陳水扁決定終止“國統會”運作，目的是繼續制造兩岸的緊張與對峙，為“臺獨”勢力找回生存空間。
浦東臺灣經濟研究中心秘書長盛九元指出，從“一邊一國”到“憲改”、從“積極管理，有效開發”到“廢統”，陳水扁之流一直行進在“臺獨”的不歸路上。陳水扁執意推行激進“臺獨”路線，在臺灣內部和兩岸之間全面挑起對抗沖突，只能進一步給臺灣經濟、社會帶來災難。
